不同類型滅菌器的最短滅菌時間有基本要求：下排氣式滅菌器滅菌溫度為121℃，敷料滅菌最短時間30分鐘，器械滅菌最短時間20分鐘；預真空式滅菌器滅菌溫度在132～ 134℃，敷料與器械滅菌最短時間均為4分鐘。硬質容器和超大超重包裝，應遵循廠家提供的滅菌參數。

    被朊病毒污染的器具或物品的滅菌要遵循《醫療機構消毒技術規范》WS/T 367：其滅菌時間可達60分鐘。

    滅菌（最短）時間”是指滅菌介質（蒸汽）與被滅菌物體的接觸時間，即：暴露時間，并不包含滅菌器的預熱、預真空、排氣及干燥時間。

    隨著醫療技術的不斷發展和診療器械的日益復雜，以下這三種情況需要延長滅菌時間：

    1. 密度較大的器械包或成套器械。因其會吸收大量的熱量，使得器械升溫變慢。

    2.狹窄管腔類的器械。由于管徑較小，里面容納的水蒸氣也較少，攜帶的熱量很難使管腔內壁加熱充分，或者說是熱“透”。

    3. 某些歐洲生產的器械。出于對能夠引起瘋牛病的朊病毒的擔心，某些歐洲國家（尤其是法國）出產的醫療器械要求在134℃的條件下滅菌18分鐘。

    滅菌時間不是越長越好，隨意延長滅菌時間可能引起以下問題：

    1. 工作效率降低：盲目延長滅菌時間會增加工作量與工作時間。

     2. 器械損傷：長時間暴露在高溫、高壓中易導致器械表面涂層的剝落、器械變脆、變形，以及應力的改變。

    3. 包裝材料與封包材料失效：很多包裝材料與封包材料都是在常規滅菌參數下做的產品認證，長時間暴露于高壓、高濕環境下的后果還未知。

    4. 生物監測花費增多：對于每一種參數設定都需要每周進行生物監測，換言之采用的滅菌參數組合越多需進行生物監測的循環越多。

    5. 滅菌驗證困難：采用新的包裝方式和滅菌方式進行滅菌，應在科室內進行驗證，而驗證過程對消毒供應中心人員而言技術難度頗高。

    因此，對于是否延長滅菌時間，建議不要以延長滅菌時間的方式來應對滅菌器或滅菌裝載的問題。使用滅菌監測技術確保滅菌器的狀態，并且嚴格按照規范裝載，如預真空滅菌器裝載不超過90%，下排氣滅菌器裝載不超過80%。參照待滅菌器械說明書（IFU）確定是否需要延長滅菌時間。一般進口器械都會寫明，規范的國產器械也越來越多地注明器械滅菌要求。盡量把需延長滅菌時間的物品集中到同一鍋次進行滅菌，充分提高工作效率。