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嘉峪檢測網(wǎng) 2024-05-20 08:39
以人群為基礎(chǔ)的診斷可導(dǎo)致更高的生存率、更低的發(fā)病率和更低的醫(yī)療保健費(fèi)用,特別是癌癥等疾病。然而,由于缺乏高準(zhǔn)確性和可負(fù)擔(dān)性的診斷工具,導(dǎo)致未確診病例的比例很高,特別是在中低收入國家。由于無需大容量樣本載體(如采血管)、苛刻儲存條件以及冷鏈運(yùn)輸,干血點(diǎn)標(biāo)本(DSS)領(lǐng)域最近得到發(fā)展,利于在中心實(shí)驗(yàn)室集中檢測。
目前,干血點(diǎn)試驗(yàn)已經(jīng)證明在代謝研究中取得了大規(guī)模的成功,覆蓋了發(fā)達(dá)國家95%以上的新生兒篩查先天性代謝疾病。蛋白質(zhì)在干血點(diǎn)的過程中很容易滅活和降解,遠(yuǎn)遠(yuǎn)不足以檢測癌癥分析物。相比之下,大多數(shù)代謝物在干血點(diǎn)上保持穩(wěn)定。代謝診斷可以識別癌癥代謝異常的個體,特別是在欠發(fā)達(dá)地區(qū)。
近日,雜志Nature sustainability上發(fā)表了一篇題為“A sustainable approach to universal metabolic cancer diagnosis”的文章。作者提出了一種結(jié)合干血清斑(DSS)和納米粒子增強(qiáng)激光解吸/電離質(zhì)譜(NPELDI MS)來檢測代謝物的診斷方法,可在幾分鐘內(nèi)以低成本,環(huán)境友好,血清等效精度和用戶友好的方法診斷多種癌癥。這項(xiàng)工作為提供更可持續(xù)的代謝診斷和最大的健康收益提供了見解。
主要內(nèi)容
NPELDI MS平臺
為了敏感、特異和可重復(fù)的代謝檢測,作者首先檢測了傳統(tǒng)LDI MS平臺中使用的有機(jī)基質(zhì)DHB,但效果不理想。作者嘗試應(yīng)用無機(jī)納米顆粒來替代有機(jī)基質(zhì)(圖a-c)。通過將鐵系納米顆粒分布在不銹鋼靶板上,構(gòu)建了可并行檢測384個樣本的多路代謝物微陣列(圖d)。
靈敏度檢測結(jié)果顯示,檢測限低至0.07μM。且特異性檢測結(jié)果表明,鐵納米顆粒從復(fù)雜生物標(biāo)本中直接提取代謝物有尺寸效應(yīng),表明NPELDI MS對代謝物具有選擇性。不僅如此,實(shí)驗(yàn)結(jié)果還表明NPELDI MS的數(shù)據(jù)具有可重復(fù)性,變異系數(shù)(c.v.)<13%(圖f)。數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性歸因于代謝物和鐵NPs之間的均勻共結(jié)晶(圖g)。
NPELDI MS平臺。圖片來源:Nature sustainability
可行性分析
作者下一步旨在了解從DSS中提取的代謝物是否可以使用NPELDI MS進(jìn)行可靠的定量和分析。作者選擇葡萄糖和乳酸作為指標(biāo),觀察到NPELDI MS的檢測(圖a)中指示分子的峰值強(qiáng)度的變化,分別對應(yīng)于代謝物濃度0.10-5mM和0.05-5mM。相比商業(yè)生化試劑盒,重復(fù)性相似,但節(jié)約了10倍樣本體積及檢測時間。
進(jìn)一步的評價結(jié)果顯示,DSS提取物與血清樣本中的代謝物定量呈線性相關(guān),葡萄糖的Pearson相關(guān)性為0.918,乳酸的相關(guān)性為0.925(圖d)。對于非靶向代謝譜,作者比較了從配對的DSS和血清樣本中獲得的光譜一致性。共檢測到198個MS峰,與133種代謝物相匹配,涵蓋了各種生化指標(biāo)(圖g)。其中110個(55.6%)MS峰在DSS和血清都能檢測到(圖e)。大多數(shù)MS峰在至少有80%的樣本中都能檢測到(圖f),表明從配對的DSS和血清樣本中獲得的代謝譜的一致性。
這些結(jié)果表明,來自DSSs的代謝物允許其用于疾病診斷的分類任務(wù)。
可行性分析。圖片來源:Nature sustainability
DSS樣本不同存儲條件對檢測的影響
作者還測試了DSS樣本在不同存儲條件和穿孔取樣位置對代謝譜檢測的影響(圖a)。
DSS樣品在不同存儲環(huán)境如空氣中,真空和純N2存儲6h后代謝譜表現(xiàn)出較高的穩(wěn)定性,檢測結(jié)果與血清樣本相似。DSS和血清樣本之間相似性得分為:空氣為0.729 ± 0.013,真空為0.734 ± 0.011,純N2為0.754±0.035(圖b)。DSS樣品在不同的存儲溫度如−20°C、4°C、r.t.和40°C的空氣中保存6小時后,表現(xiàn)出代謝譜對環(huán)境熱變化具有良好的抗性,相似性得分超過0.93(圖c)。相比之下,血清中的非靶向代謝譜隨著溫度變化而顯著波動。DSS在空氣中6天內(nèi)連續(xù)記錄非靶向代謝譜。在不同存儲時間下,代謝譜變化很少,平均相似度得分均超過0.95(圖d)。相比之下,與0 h相比,血清樣本保存144 h的相似性得分顯著下降到0.634(圖e)。
DSS樣本不同存儲條件對檢測的影響。圖片來源:Nature sustainability
DSS樣本不同穿孔取樣位置對檢測的影響
作者在同一DSS內(nèi)的4個不同位置進(jìn)行了3次重復(fù)的代謝譜分析(上圖f),結(jié)果顯示從DSS中提取的代謝物含量不依賴于一定的穿孔位置。相比之下,從全血樣本中制備的干血點(diǎn)(DBS),DBS的不同沖孔位置和中心區(qū)域在兩者之間觀察到明顯的變異性,可能歸因于當(dāng)細(xì)胞和血漿成分分離時,分析物濃度在不同元素之間的分布不均勻。
DSS代謝譜進(jìn)行癌癥診斷
作為概念驗(yàn)證,作者分析了180例DSSs的非靶向代謝譜。與血清樣本相比,從DSS中獲得的非靶向代謝譜產(chǎn)生了一致的讀數(shù),并顯示出相當(dāng)?shù)蔫b別能力(圖c、d),證實(shí)了非靶向DSS代謝譜的潛在診斷能力。DSS衍生的模型來區(qū)分癌癥患者,受試者工作特征曲線下面積(AUROCs)訓(xùn)練集為0.841–0.993,驗(yàn)證集為0.900–1.000(圖e)。
接下來,作者將所有圖譜作為機(jī)器學(xué)習(xí)的輸入,并確定了健康人群(HD)與不同癌癥組之間存在顯著差異的代謝物(圖f)。在DSS和血清模型中,有2種共同上調(diào)和2種共同下調(diào)的代謝物,并建立了三個分類器,以AUROC 0.750/0.924/0.986區(qū)分PC/GC/CC組和HD組(圖e)。總的來說,這些發(fā)現(xiàn)證明了DSS代謝分析在發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物方面的潛力。
DSS代謝譜進(jìn)行癌癥診斷。圖片來源:Nature sustainability
DSS代謝診斷的可持續(xù)性和經(jīng)濟(jì)評價
確保疾病的可持續(xù)診斷已引起全球越來越多的關(guān)注。成本效益是疾病篩查的關(guān)鍵。NPELDI質(zhì)譜方法的特點(diǎn)是直接的代謝分析,不需要樣品預(yù)處理,允許提高分析速度(~秒)。相比之下,傳統(tǒng)的代謝分析方法需要繁瑣的樣品預(yù)處理,如色譜串聯(lián)質(zhì)譜(每批96個樣品1-8小時)和核磁共振(每批96個樣品1-2小時)。
此外,DSS中獨(dú)特的基質(zhì)避免了昂貴的冷鏈運(yùn)輸,減少了存儲空間,降低了運(yùn)輸和存儲成本,將生物樣本庫的樣品容量提高了10倍。作為NPELDI質(zhì)譜分析試劑盒中最重要的試劑,單次合成的鐵NPs的化學(xué)品成本為2.15美元,重量大約為600毫克,產(chǎn)量足以滿足400,000次質(zhì)譜測試(每質(zhì)譜測試需要~1.5μg)。因此,考慮到實(shí)驗(yàn)產(chǎn)量和費(fèi)用,NPELDI MS平臺本身可以成為大規(guī)模臨床使用的成本效益的工具。
除了在資源消耗和化學(xué)危害方面比塑料血清低溫保存管具有更大的可持續(xù)性,在生物安全方面,DSS制備中的樣品干燥可以被認(rèn)為是一種失活過程,排除了潛在的感染風(fēng)險,且生物安全問題較低。相比之下,來自感染血源性感染源的患者的血清樣本具有高致病性,需要敏感的病毒檢測和額外的失活/去除技術(shù)。
總結(jié)與討論
作者提出了一種結(jié)合干血清斑(DSS)和納米粒子增強(qiáng)激光解吸/電離質(zhì)譜(NPELDI MS)的診斷方法,可在幾分鐘內(nèi)以低成本,環(huán)境友好,血清等效精度和用戶友好的方法診斷多種癌癥。整個方法允許可持續(xù)的代謝診斷,并且比現(xiàn)有的臨床診斷檢測具有幾個優(yōu)勢,比如具有顯著的成本效益,無需昂貴的冷鏈運(yùn)輸,減少了存儲空間,降低了運(yùn)輸和存儲成本,且生物安全問題較低。基于DSS的NPELDI MS診斷方法對其他疾病實(shí)體的驗(yàn)證還需要進(jìn)一步的研究。迫切需要開發(fā)廉價和便攜的MS平臺,以在疾病負(fù)擔(dān)沉重的地區(qū)實(shí)現(xiàn)即時檢測。
總之,作者提出了一種標(biāo)準(zhǔn)化工作流程的方法,包括NPELDI MS和基于紙張的DSS的可持續(xù)代謝診斷。基于優(yōu)化的工作流程,該方法是實(shí)用的,即使在資源有限的臨床環(huán)境中,由當(dāng)?shù)匦l(wèi)生工作者在資源有限的臨床環(huán)境中進(jìn)行,也可以實(shí)現(xiàn)高水平的診斷準(zhǔn)確性。這項(xiàng)工作為提供更可持續(xù)的代謝診斷和最大的健康收益提供了見解。
來源:小桔燈網(wǎng)