您當前的位置：首頁 > 資料中心 > 人腫瘤lncRNA PCR芯片
PCR ARRAY介紹
PCR ARRAY又稱PCR芯片，運用高通量熒光定量PCR方法，在一張96孔或384孔板上同時對某個信號通路或疾病相關基因的表達量變化進行檢測，芯片上的基因包括了與研究對象有確定關系的基因或者待考證的基因；目前啟因生物針對不同的信號通路和疾病相關基因設計了150多款功能分類PCR芯片，涵蓋生命科學研究的各個領域。
人腫瘤lncRNA PCR芯片介紹
啟因生物的人腫瘤lncRNA PCR ARRAY含有84個人腫瘤lncRNA 相關基因，包括：乳腺癌，肺癌，卵巢癌，神經母細胞瘤，黑色素瘤，膽囊癌等數十種腫瘤或癌癥類型。
產品說明
|
產品名稱 |
人腫瘤lncRNA PCR芯片 |
|
英文名稱 |
Human Glucose Metabolism PCR Array |
|
貨 號 |
sp-TWCPAHM-0011 |
|
基因數目 |
84個 |
|
基因名稱 |
見基因列表 |
|
檢測費用 |
800元/樣(活動價） |
|
樣本類型 |
細胞，組織等 |
|
項目周期 |
2周（不含節假日） |
|
實驗結果 |
原始數據，數據分析 |
|
技術原理 |
*相對定量，SYBR Green法 |
*相對定量：用于測定一個測試樣本中目標基因與校正樣本中同一基因表達的相對變化。校正樣本可以是一個未經處理的對照或者是在一個實驗研究中處于零時的樣本。
服務特點
1. 只需提供樣品
2. 數據分析多樣性選擇
3. 中低通量，一次性檢測多個相關基因的表達水平
4. 周期短
5. 結果不需要qPCR驗證
服務流程
1. 確定實驗方案，簽合同
2. 樣品寄出（-80℃順豐寄出）
3. 收樣后進行質控
4. 質控過關，上機檢測
5. 數據分析
樣品預處理方法
為了避免樣品中RNA降解，需對樣品進行預處理。
|
樣品類型 |
處理方法 |
送樣量 |
|
貼壁細胞 |
①倒出培養液，用 1×PBS 清洗一次。 |
至少1×106個細胞 |
|
懸浮細胞 |
①將懸浮培養細胞連同培養液一起倒入離心管中，8,000 g 4℃離心2 分鐘，棄上清。 |
至少1×106個細胞 |
|
組織（動物器官類） |
離心管中加1 ml 的 trizol，確保浸沒組織，-80℃保存 |
至少20mg,約小黃豆大小 |
檢測流程：
1. 樣品總RNA提取
2. RNA質量檢測，檢測RNA純度及完整度，提供RNA質量報告；
3. cDNA合成，使用逆轉錄酶，將樣品RNA逆轉錄為cDNA；
4. 實時定量PCR反應；
5. 數據分析，計算PCR芯片中的各個Ct值，采用ΔΔCt方法比較基因的表達變化，并利用公司自主開發的數據分析軟件進行比較。
|
數據圖 |
|
|
|
火山圖——是在一張圖中利用P值和表達差異值分析做圖，可以非常的直觀且合理地篩選出在兩樣本間發生差異表達的基因。
|
|
|
維恩圖——不同的實驗組（集合）之間的基因的相互關系。
|
|
|
柱狀圖——能夠直觀的反映不同樣本的基因表達情況的差異。 |
|
|
散點圖——用兩組數據構成多個坐標點，考察坐標點的分布，判斷兩變量之間是否存在某種關聯或總結坐標點的分布模式。
|
|
|
熱圖——熱圖是對實驗數據分布情況進行分析的直觀可視化方法，可以用來進行實驗數據的質量控制和差異數據的具像化展示，還可以對數據和樣品進行聚類，觀測樣品質量。
|
基因列表
|
7SK |
DAOA-AS1 |
IGF2-AS |
PCAT19 |
|
7SL |
DGCR5 |
IPW |
PCGEM1 |
|
ASFMR1 |
DISC2 |
KCNQ1DN |
PDZRN3-AS1 |
|
ATP6V1G2-DDX39B |
DLEU1 |
KCNQ1OT1 |
PISRT1 |
|
ATXN8OS |
DLEU2 |
LINC00032 |
PRINS |
|
BACE1-AS |
DLX6-AS1 |
LINC00162 |
PTCSC1 |
|
BCAR4 |
DNM3OS |
LINC00271 |
PVT1 |
|
BCYRN1 |
DSCAM-AS1 |
LSAMP-AS3 |
RMST |
|
BDNF-AS1 |
EPB41L4A-AS1 |
MALAT1 |
SCAANT1 |
|
BOK-AS1 |
ESRG |
MEG3 |
SNHG11 |
|
BPESC1 |
FMR4 |
MESTIT1 |
SNHG3 |
|
CASC2 |
GAS5 |
MIAT |
SNHG4 |
|
CBR3-AS1 |
GDNFOS |
MIR100HG |
SNHG5 |
|
CCAT1 |
H19 |
MIR155HG |
SOX2-OT |
|
CDKN2B-AS1 |
HAR1A |
MIR17HG |
SPRY4-IT1 |
|
CECR3 |
HAR1B |
MKRN3-AS1 |
SRA1 |
|
CECR9 |
HIF1A-AS1 |
MYCNOS |
TCL6 |
|
CERNA2 |
HOTAIR |
NAMA |
TDRG1 |
|
CHL1-AS2 |
HOXA11-AS |
NEAT1 |
TERC |
|
CRNDE |
HYMAI |
PCA3 |
TP53COR1 |
|
CUDR |
IFNG-AS1 |
PCAT1 |
TRAF3IP2-AS1 |
（更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查詢）
參考文獻
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)
Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)
Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.（IF6.065）
|
公司地址： |
城北路1355號上海大學科技園A901室 |
||
|
Q Q： 2850925266 / 2850925265 |
|||
|
電 話： |
0212-63935065 |
|
|
|
官 網： |
www.wcgene.com |
|
|
下載該資料的還下載
相關資料
相關評論
您的評論： 推薦
發表評論 可以輸入500字